COLNATOR - Caractérisation de la collection nationale de ressources génétiques d’orge

2021
La collection nationale d’orge, regroupant 570 accessions francaises, a ete evaluee pour une dizaine de caracteres agro-morphologiques (precocite, hauteur, sensibilite a la verse, compacite et nombre de rangs de l’epi, sensibilite aux pathogenes : rouille naine, oidium, rhynchosporiose, helminthosporiose, ramulariose), dans un reseau de dix sites. Par ailleurs, la collection a ete genotypee pour 1056 SNPs repartis sur l’ensemble du genome. Les resultats d’evaluation agronomique mettent en evidence une large variabilite pour l’ensemble des caracteres observes. L’application d’un index empirique de selection sur les caracteres de sensibilites aux maladies a permis de definir parmi la collection deux panels (type hiver et printemps) de 43 accessions chacun, montrant de bons niveaux de resistances aux cinq pathogenes etudies. A partir des donnees SNPs, l’analyse de la structure de la collection a confirme l’importance du type hiver vs printemps et du nombre de rangs de l’epi comme facteurs structurants. Par la suite, une premiere approche de genetique d’association a permis de reveler au total 1666 associations statistiquement significatives entre phenotypes et genotypes aux marqueurs etudies. L’ensemble des donnees d’evaluation sera bientot publiquement accessible sur le net (https://urgi.versailles.inra.fr/siregal/siregal/grc.do) et la collection nationale declaree comme contribution francaise au traite international sur les ressources phytogenetiques.
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