Le paysage et la structure de la communauté des micromammifères agissent différemment sur la prévalence d'Anaplasma phagocytophilum et Borrelia burgdorferi sensu lato dans cette commauté

2017 
Les changements globaux, en modifiant les paysages et les ecosystemes, peuvent avoir des consequences importantes sur l'emergence ou la reemergence de maladies vectorielles. Dans notre etude, au cours du projet OSCAR (Outil de simulation Cartographique a l'echelle du paysage Agricole du Risque acarologique), nous voulions identifier les effets du paysage sur la prevalence chez les micromammiferes de deux agents infectieux transmis par les tiques, Anaplasma phagocytophilum et Borrelia burgdorferi s.l.. Nous avons cherche des relations a la fois avec des variables paysageres et avec la structure meme de la communaute de micromammiferes. Nous avons echantillonne dans 24 sites situes le long d'un gradient de fragmentation de l'habitat boise et de lineaire de haies. Nous avons mesure pour chaque site des variables structurelles du contexte paysager environnant relatives a sa composition et a sa configuration a differentes echelles, ainsi que des variables fonctionnelles de connectivite de l'habitat, pour les micromammiferes, basees sur la theorie des graphes et des chemins de moindre cout. La communaute de micromammiferes a ete caracterisee par l'abondance relative de chaque espece, et la richesse specifique. Les agents infectieux ont ete recherches par PCR dans des echantillons de tissus des micromammiferes. Nous avons trouve que la prevalence d'A. phagocytophilum etait plus forte dans les paysages boises et plus faible dans les paysages avec beaucoup d'ecotones boises (interface bois / haie-prairie / culture). Elle etait aussi liee positivement a l'abondance du Campagnol roussâtre (Myodes glareolus), qui sont de bons reservoirs par rapport au Mulot sylvestre (Apodemus sylvaticus), l'espece dominante dans nos captures. La prevalence etait aussi positivement reliee a la richesse specifique en micromammiferes, peut-etre de par la presence d'especes moins frequentes, mais meilleurs reservoirs. Cependant, nous n'avons pas trouver de correlation entre les variables paysageres et ces variables de communaute de micromammiferes, ce qui suggere l'importance d'autres mecanismes de structuration des communautes de micromammifere comme la qualite de l'habitat ou la pression de predation. Concernant B. burgdorferi s.l., aucune variable n'etait significativement reliee a sa preferentielle par une espece de tique plus generaliste, une gamme d'hote reservoirs plus large, et la circulation de plusieurs genoespeces que nous n'avons paa pu identifier systematiquement. Cette etude montre l'interet de considerer les interactions entre les agents infectieux et leurs especes hotes, plus ou moins competentes en tant que reservoirs, pour mieux comprendre les effets du paysage sur la transmission de maladies
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