Análisis del genoma de pycnoporus cinnabarinus mediante electroforesis de campo pulsado

En el presente trabajo se describe la separacion optima de moleculas de DNA cromosomico intacto del hongo filamentoso Pycnoporus cinnabarinus, mediante electroforesis de campo pulsado usando un sistema de contorno de campo electrico homogeneo (CHEF), con un electrodo hexagonal. Se estudio una serie de condiciones experimentales en las cuales se hizo variar la duracion del intervalo de tiempo en cada direccion del campo y el tiempo total de la corrida. De esta manera fue posible separar el DNA cromosomico de P. cinnabarinus en cuatro bandas que, dependiendo de las condiciones electroforesis, pueden ser resueltas por lo menos en siete bandas. Utilizando los patrones de migracion del DNA cromosomico de Saccharomyces cerevisiae y Schawanniomyces occidentalis como estandar, estimamos que los tamanos moleculares del DNA cromosomicos de P.cinnabarinus oscilan entre 1.9 y 2.5 megabases (mb)