Identification des fonctions biologiques, spécifiques d’un tissu ou partagées entre tissus, associées aux différences d’efficacité alimentaire chez le porc en croissance

Cette etude vise a decrire les reponses moleculaires communes entre tissus ou specifiques d’un tissu chez des porcs en croissance selectionnes de maniere divergente sur la consommation moyenne journaliere residuelle (CMJR), une mesure de l'efficacite alimentaire. Des donnees transcriptomiques ont ete acquises dans le muscle long dorsal, le foie et deux tissus adipeux, et analyses pour l'effet de la lignee (n = 24 porcs par lignee). La divergence de CMJR affecte principalement le profil moleculaire du muscle, alors que le tissu adipeux sous-cutane est peu affecte. Des analyses de bio-informatique et de statistiques multidimensionnelles ont ete mises en oeuvre afin de determiner les processus biologiques communs aux quatre tissus et les principaux genes participant a la difference interindividuelle de CMJR. Les fonctions immunitaires, la reponse au stress oxydant et le metabolisme proteique sont les voies communes aux quatre tissus qui distinguent les porcs en fonction de la CMJR. De nombreux genes immunitaires sont actives chez les porcs a CMJR elevee (les moins efficaces). Les genes associes aux metabolismes du glucose et des lipides sont egalement affectes par la selection mais d'une maniere specifique a chaque tissu. Ainsi, les genes impliques dans le metabolisme du glycogene sont actives dans le muscle des porcs a faible CMJR (les plus efficaces). Les genes en lien avec l’oxydation des acides gras sont reprimes dans le muscle mais actives dans les deux tissus adipeux de ces memes porcs. Le metabolisme du cholesterol dans le foie et la panne semble egalement affecte par la selection sur la CMJR. En conclusion, les fonctions non productives comme l’immunite et la defense contre le stress oxydant participeraient donc aux variations d'efficacite alimentaire.