Highly successful treatment outcome of multidrug‐resistant and genetic diversity of multidrug‐resistant Mycobacterium tuberculosis strains in Rwanda

OBJECTIF: Determiner les genotypes prevalents de la TB-MDR et decrire les resultats du traitement et la conversion bacteriologique chez les patients atteints de TB-MDR. METHODES: Analyse des dossiers de laboratoire de 173 patients atteints de TB-MDR de l'ensemble du Rwanda qui ont debute un traitement sous prise en charge programmatique de la TB-MDR (PMDT) entre 2014 et 2015. Cinquante isolats archives disponibles ont ete genotypes pour les unites repetitives intercalees de mycobacteries - nombre variable de tandems repetes (MIRU-VNTR). RESULTAT: Sur les 170 patients dont l'issue etait connue, 114 (66,3%) etaient gueris et 36 (21%) avaient termine le traitement, ce qui donne un resultat positif (gueri et complete) de 150 patients (87,3%). Sur 20 patients atteints de TB-MDR dont l'issue du traitement etait defavorable, 18 sont decedes, un a eu un echec et le dernier a abandonne/arrete le traitement. Sur les 18 patients decedes, 11 (61%) etaient coinfectes par le VIH. Le resultat du traitement a ete positif pour 93,9% des personnes VIH negatives et 81,8% pour ceux coinfectees par le VIH (p = 0,02). La conversion des frottis d'expectoration est survenue chez 3, 46, 57 et 78 patients respectivement a 2, 3, 4 et 6 mois, avec une duree mediane entre le frottis d'expectoration et la conversion de culture de 3 mois. Les 44 isolats de TB-MDR avec un resultat MIRU-VNTR ont montre une diversite genetique elevee avec un faible taux de regroupement (9,09%) et la sous-famille de la lignee Ouganda II etant la plus prevalente detectee dans 68,2% des isolats. La famille Beijing etait le genotype le moins frequemment detecte (2,3%, 1 isolat). CONCLUSION: Les taux de succes eleves du traitement de la TB-MDR obtenus au Rwanda etaient comparables aux resultats observes dans les regions riches en ressources, le VIH etant un facteur de risque independant d'un mauvais resultat du traitement. La diversite genetique elevee et le faible taux de regroupement rapportes ici suggerent que la reactivation d'une maladie anterieure joue un role important dans la transmission de la TB-MDR au Rwanda. RESULT: Of the 170 patients whose outcome was known, 114 (66.3%) were cured and 36 (21%) completed the treatment, giving a successful outcome (cured and completed) of 150 (87.3%) patients. Of 20 MDR-TB patients with unfavourable treatment outcome, 18 died, one failed and one defaulted/stopped treatment. Of the 18 patients who died, 11 (61%) were HIV-coinfected. The treatment outcome was successful for 93.9% among HIV negative and 81.8% among HIV-coinfected patients (P = 0.02). Sputum smear conversion occurred in 3, 46, 57 and 78 patients before 2, 3, 4 and 6 months, respectively, with median time of sputum smear and culture conversion at 3 months. The 44 MDR-TB isolates with MIRU-VNTR result, showed high genetic diversity with low clustering rate (9.09%) and Uganda II being the most prevalent sub-family lineage detected in 68.2% of isolates. Beijing family was the least common genotype detected (2.3%, 1 isolate). CONCLUSION: The high success rates for MDR-TB treatment achieved in Rwanda were comparable to outcomes observed in resource-rich settings with HIV being an independent risk factor for poor treatment outcome. High genetic diversity and low clustering rate reported here suggest that reactivation of previous disease plays an important role in the transmission of MDR-TB in Rwanda.